ScienteПуть знания

Источники знаний: мировые базы, база статей и полный текст в одном проекте

Хороший обзор начинается не с текста, а с корпуса: какие статьи найдены, какие отобраны и почему остальные исключены. В Sciente за это отвечает модуль «Источники знаний» — поиск по мировым базам, база статей проекта, читалка и граф цитирований. Разбираем, что в нём есть и как это помогает собрать корпус, который выдержит вопросы рецензента.

Источники знаний: мировые базы, база статей и полный текст в одном проекте

Почему одной базы мало

Самая известная биомедицинская база — PubMed, но часть работ лежит за её пределами: в журналах издательств, в архивах открытого доступа, в региональных журналах, в препринтах. Поэтому в систематических обзорах принято искать минимум в нескольких источниках и описывать стратегию поиска так, чтобы её можно было повторить.

Где ищет поиск проекта

ИсточникЧто в нём
PubMedбиомедицинская литература, ядро — MEDLINE
Europe PMCаннотации и полные тексты открытого доступа
DOAJ и архив DOAJжурналы открытого доступа
Wileyстатьи журналов издательства
J-STAGEяпонские научные журналы
SciELOжурналы открытого доступа Латинской Америки, Испании, Португалии и ЮАР
bioRxiv, medRxivпрепринты — работы до журнальной рецензии

Отдельно на сайте работает открытый поиск научных статей — по PubMed и Crossref, без входа в аккаунт. Поиск в проекте и открытый поиск — разные инструменты: первый складывает найденное в проект, второй помогает быстро оценить тему.

Иллюстрация 1 к статье «Источники знаний: мировые базы, база статей и полный текст в одном проекте»

Как искать медицинские статьи по теме

Начните с исследовательского вопроса, затем соберите синонимы и MeSH-термины и проверьте запрос в выбранной базе. В руководстве по поиску медицинских и научных статей разобраны пример PubMed, поиск по DOI и PMID, русскоязычный вопрос и получение доступного полного текста. Сохраняйте точные запросы, даты и причины отбора: найденная запись ещё не означает, что источник подходит для вашего вывода.

Когда корпус отобран и проверен, переходите к подготовке медицинской научной статьи: источники должны поддерживать утверждения рукописи, а не просто заполнять библиографию.

Мультипоиск: очередь запросов

Один запрос почти никогда не находит всё. У вмешательства есть несколько названий, у исхода — разные формулировки, у популяции — синонимы. Обычно стратегию собирают из нескольких запросов и проверяют, что каждый добавляет новые работы.

В Sciente мультипоиск устроен как очередь. Исследователь сам добавляет несколько запросов — например, отдельно по классу препаратов и отдельно по конкретному препарату с исходом, — а продукт проходит их по порядку и показывает ход: «выполнено 2 из 3». Тему в поиске проекта можно писать по-русски. Найденное попадает в кандидаты проекта.

Формулировки запросов стоит сохранить в описании методов: даты поиска, источники и точные строки запросов — обязательная часть отчёта по PRISMA 2020.

База статей: статусы и причины

Каждая найденная статья получает статус: кандидат, отобрана или исключена. Исключение делается с причиной, и она не пропадает: причина попадает в журнал решений и в схему PRISMA. Это та информация, которую через полгода спросит рецензент: сколько работ найдено, сколько отсеяно на каждом этапе и почему.

Корпус на одном экране

Когда в проекте сотни статей, список перестаёт давать картину. В разделе «Паспорт работы → Обзор → Корпус статей» собран дашборд корпуса: воронка отбора, покрытие данных, статусы, качество, дизайны исследований и распределение по годам. По нему видно, например, что в корпусе мало рандомизированных исследований или что почти все работы старше пяти лет.

Иллюстрация 2 к статье «Источники знаний: мировые базы, база статей и полный текст в одном проекте»

Полный текст внутри проекта

Аннотации хватает, чтобы решить, читать ли статью. Для отбора по полному тексту, оценки качества и точной цитаты нужен сам текст. Статья в Sciente открывается в боковой панели проекта: аннотация, полный текст — если он есть в открытом доступе, — содержание с переходом к разделам. Числа и p-значения в тексте подсвечены, поэтому результаты видны без перечитывания абзацев.

Если открытого полного текста нет, его можно приложить к статье файлом. Оценка качества по стандартным шкалам строится именно по полному тексту.

Граф цитирований

Граф показывает статьи проекта узлами, а ссылки между ними — связями. Фильтры — по глубине связей, статусу, источнику и году: можно оставить только отобранные работы или только последние годы. При наведении на узел видна карточка статьи. На графе заметны работы, на которые ссылаются почти все остальные, — их стоит прочитать полностью, даже если поиск поставил их далеко в списке.

Иллюстрация 3 к статье «Источники знаний: мировые базы, база статей и полный текст в одном проекте»

Расширение для браузера

Статью, найденную на странице журнала или PubMed, расширение «Sciente — добавить статью» кладёт в проект: DOI со страницы подставляется сам, остаётся выбрать проект и статус. Подключение — по ключу из настроек Sciente. Расширение работает в Chrome, Яндекс Браузере, Edge и Opera.

Что остаётся за исследователем

Поиск находит, база хранит, граф показывает связи — но решение, какие работы войдут в обзор, принимает исследователь. Причины исключения стоит формулировать так, чтобы их понял посторонний человек: «другая популяция», «нет группы сравнения», «обзор, а не первичное исследование».

Промокод START даёт +100 % к пополнению от 990 ₽: бонус не больше 10 000 ₽, один раз на аккаунт, бонусные средства действуют до 31.12.2026.

Как перейти от полного текста к оценке

Когда полный текст получен, используйте пошаговый критический анализ научной статьи, чтобы отделить полноту описания от риска систематической ошибки и применимости результата.

Попробуйте это в своём проекте

Поиск статей, отбор, оценка доказательности, статистика и рукопись с цитатами в одном рабочем месте.

Создать проект